全文以年幼的贵树与东京的同学明里由友谊到爱情，最后却以叹婉的错过而结尾，miss代表着思念也代表着错过，明里与贵树便是这样在这样的思念中错过了。
整部动漫分切三部分:樱花抄（年幼的明里与贵树分别，懵懂的初恋面临破碎，明里约贵树地铁站相见，贵树从信中读到了明里的孤单，决定赴约，而大雪使得贵树迟到两个多小时，本以为明里会回家，大雪的夜里贵树也是希望明里回家，可却是在地铁站看见了孤单的明里，两人也是低头，泪水诉说着思念。）宇航员（这一部分，愈见成熟的贵树结识了鹿儿岛的女孩花苗，花苗一直在默默守护着对贵树的爱恋，最后也是未曾勇敢的说出自己的心意，也是带给了我们无尽的惋惜，其实我一直都在疑惑，为看着火箭划开天际这时的花苗是有着怎样的复杂情绪，大概是感觉到贵树是对自己没有感觉所以才是最后也是没有说明自己的心意。）秒速五厘米（成年后的明里与贵树有了自己的生活也有了自己的圈子，但是贵树也还是会为了窗边飘落的樱花花瓣沉思，明里也会为一丝遐想而驻足，最后两人仍旧是在那个熟悉的地方错身而过，一段可能的美好便是仍旧破碎。）
曾经看过网上有人这样解释秒五“在秒速五厘米间，他们发现了彼此。也在秒速五厘米之间，他们错过了彼此。”与其好心地安排一次重逢，不如就这样错过。ONE MORE TIME ONE MORE CHANCE,这句话也许就是两人之间等待无果的一句悲伤的缩影。更符合一种情境，归根到底是一个男孩和一个女孩相遇的故事，发生在秒速五厘米，短暂而恒久的瞬间。我想说的是，人生，注定留有遗憾。错过的不一定再有，但生活还在继续。想来新海诚也就是想要的效果都得到了完美的收效，他轻轻的吹出一个又一个美丽的泡泡而又一次又一次悄悄的点破，留下的只有叹息。
